Het Functioneel Parket (FP) is op 1 januari 2003 opgericht en heeft tot doel om de criminaliteit te bestrijden op het gebied van milieu, economie en fraude. Omdat dit werkterrein breed is, is in eerste instantie bepaald dat het FP verantwoordelijk is voor de opsporing en vervolging in die strafzaken, waarin een bijzondere opsporingsdienst (BOD) de trekkende rol vervult.
De BOD'en zijn:
Sinds oktober 2005 zijn daar vrijwel alle milieuzaken van de regiopolitiekorpsen bijgekomen, evenals alle zaken van de regionale inspectiediensten van VROM en de AID. Het FP is ook belast met de handhaving van de wetgeving voor de visserij en de veiligheid op de Noordzee.
De organisatie telt inmiddels 250 medewerkers, waaronder circa 60 officieren van justitie, met een 'omzet' van 10.000 strafzaken per jaar. Het Functioneel Parket is het vierde in grootte na de arrondissementsparketten van Amsterdam, Rotterdam en Den Haag.
Het Functioneel parket heeft een landelijke taak, maar om deze goed uit te kunnen voeren zijn meerdere vestigingen nodig. De parketleiding is gevestigd in Den Haag. Daarnaast kent het Functioneel parket vier handhavingseenheden ( HHE). Iedere HHE heeft een eenheid Milieu en eenheid Financieel-Economische Criminaliteit. De handhavingseenheden zijn gevestigd in Zwolle, Den Bosch, Amsterdam en Rotterdam.