Op zaterdag 20 september, de dag van de rellen, is de politie meteen een strafrechtelijk onderzoek gestart onder leiding van het Openbaar Ministerie. Het onderzoek richt zich primair op het in kaart brengen van het geweld dat is gepleegd en het identificeren van de geweldsplegers. De politie is belaagd, maar ook journalisten en later zijn er nog vernielingen gepleegd in de binnenstad aan onder meer het partijkantoor van D66 en bij het Binnenhof. In het onderzoek wordt ook aandacht besteed aan strafbare discriminatie, onder meer naar aanleiding van aangiften. Ook wordt bij de geïdentificeerde geweldsplegers gekeken of zij strafbare uitingen hebben gedaan. Daarnaast wordt gekeken of er personen zijn die het geweld mogelijk hebben georkestreerd.